14歲的少女蘇菲不斷接到一些極為不尋常的來信,世界像謎團一般在她的眼底展開。在一位神秘導師的指引下,蘇菲開始思索,從蘇格拉底、柏拉圖到達爾文、弗洛伊德等哲學大師所思考的根本問題。蘇菲運用少女天生的悟性和后天知識,企圖解開這些謎團,然而,事實真相遠比她所想的更怪異、更離奇……