一只漁船在海上打撈上一個奄奄一息的男子，在救治過程中，發(fā)現(xiàn)男子身中數(shù)槍，并有刀痕。奇怪的是從臀部取出一個芯片，上面有瑞士蘇黎士銀行的一個帳號。在船員們精心的照料下，男子雖然身體康復(fù)，但是他已經(jīng)失去了往日的記憶，不知自己是誰，叫什么名字！船在西班牙停泊后他前往瑞士蘇黎士。由于沒有證件只好睡在公園的長椅上，被執(zhí)勤的警察叫醒，只想睡覺的他對警察的糾纏忍無可忍，動手打倒了警察。這時他發(fā)現(xiàn)自己不但武功高強，而且還會說多國語言。這令他莫名其妙……
與此同時，CIA（中央情報局）部署的一個被稱為“絆腳石”的計劃正在執(zhí)行中，但是派出去的干員與CIA失去了聯(lián)絡(luò)，CIA十分焦急。男子來到蘇黎士銀行寫下了那個神秘的賬號，按一切程序檢測完畢以后，銀行把保險箱拿給了他。打開保險箱后，他驚呆了，一把手槍、多國鈔票、六國護照和一個巴黎的住址，而且六本護照上寫的都是同一個名字——杰森·伯恩，這一切使他陷入了冒險的旅途。
在美國使館內(nèi)，伯恩認識了一個女孩叫瑪莉。她正與工作人員爭吵。伯恩的舉動被安檢人員發(fā)現(xiàn)，警察上前抓住伯恩，但都被他三拳兩腳打翻在地，他逃出了使館。
正當(dāng)伯恩無處可逃之時，遇到在使館見到的女孩瑪莉，他請瑪莉開車把自己送到巴黎，付一萬美元，到巴黎之后再付一萬美元，瑪莉驚喜，同意將伯恩送到巴黎。
CIA的人也在尋找失蹤的“伯恩”，因為伯恩是中情局的干員，被派出去執(zhí)行被稱為“絆腳石”的暗殺行動，但事情現(xiàn)己敗露，CIA決定除掉伯恩，因此派人到處尋找伯恩。
瑪莉開車送伯恩前往巴黎途中對他產(chǎn)生好感，決定幫助他。伯恩始終沒有搞清那個帳號、護照等等是怎么回事。他拿著巴黎的地址穿過數(shù)條街道尋找門牌號。找到之后他稍做安頓，突然一個殺手闖了進來，經(jīng)過一番激烈的撕打，殺手跳窗而逃。伯恩感到自己己被跟蹤，帶著瑪莉馬上離開了。伯恩勸告瑪莉不要跟著他，否則很危險，自己則要留下來把事情搞清楚。但瑪莉并沒有離開伯恩，為了安全，伯恩給瑪莉改變了發(fā)型。CIA在調(diào)查案子的同時，伯恩也在加速搞清事情真相。沃姆伯西在家中被殺，CIA認為是伯恩干的，因此他一直都在被追殺。自己到底是誰？是在頂替誰？這一切令伯恩百思不得其解，他到過停尸間，走訪過漁具商店經(jīng)理和航海保全部，結(jié)果都令他很失望。伯恩被八方追擊，瑪莉決定帶伯恩到朋友伊蒙家中暫避，但是在這里也同樣被盯上了。伯恩拿出一筆錢讓瑪莉趕快逃離這里。伯恩告訴瑪莉離開后千萬不要同任何人聯(lián)系。
伯恩電話中約CIA的頭目在巴黎新橋見面。CIA趁此機會加大警力，一定要除掉伯恩，伯恩在與康（CIA的頭目）對話中揭露了他的陰謀
